(sustantivo) [ecología microbiana, terminología científica, biología de insectos] Ingl.: gut microbiota / intestinal microbiota
La **microbiota intestinal** designa el conjunto de microorganismos vivos —bacterias, arqueas, protistas, hongos y virus— que residen de forma estable o transitoria en el tracto gastrointestinal de un organismo hospedador, estableciendo con él relaciones que van desde el mutualismo hasta el parasitismo. En [[termitas]], este concepto alude específicamente a la comunidad de simbiontes del intestino posterior que hace posible la nutrición a partir de lignocelulosa y el mantenimiento de la [[homeostasis]] colonial.
## Descripción ampliada
## Precisión terminológica: microbiota frente a microbioma
Los términos _microbiota_ y _microbioma_ se emplean frecuentemente como sinónimos en la literatura, pero tienen significados técnicos distintos que conviene mantener en textos especializados:
- **Microbiota**: el _quién_. Es la comunidad de organismos vivos presentes en un hábitat dado —en este caso el intestino—, describiendo su composición taxonómica (diversidad alfa y beta, abundancias relativas, riqueza de especies).
- **Microbioma**: el _qué hacen y dónde_. Incluye a los microorganismos de la microbiota, más la totalidad de sus genomas, sus metabolitos, los elementos genéticos móviles (plásmidos, fagos, transposones) y las condiciones fisicoquímicas del hábitat que los condiciona.
- **Metagenoma**: el inventario genético colectivo de la microbiota, obtenido generalmente mediante secuenciación shotgun; a veces se usa como sinónimo de microbioma en sentido estricto.
La analogía más didáctica distingue microbiota como el _censo_ (quiénes viven allí) y microbioma como el _teatro de actividad_ (qué hacen y en qué escenario). En la práctica científica cotidiana, muchos autores usan ambos términos de forma intercambiable, especialmente en ecología microbiana aplicada a insectos.
## Definición en el contexto de insectos y termitas
En entomología, la microbiota intestinal de los insectos se define como la comunidad de microorganismos que habita el tracto intestinal y realiza funciones básicas en procesos digestivos, de desarrollo y del sistema inmune del hospedador. Se distinguen dos componentes principales:
- **Microbiota residente**: microorganismos con colonización estable y duradera en el intestino, con nichos ecológicos específicos y relaciones establecidas con el hospedador.
- **Microbiota transitoria**: microorganismos ingeridos con el alimento o el entorno que permanecen temporalmente, ejercen efectos variables y son eliminados con las heces.[](https://www.inecol.mx/index.php/divulgacion/ciencia-hoy/microbios-intestinales-aliados-de-los-insectos)
En termitas, la microbiota intestinal es extraordinariamente densa y diversa, siendo una de las comunidades simbióticas más estudiadas en entomología. Su composición varía según la especie de termita, la [[casta]], la edad, la dieta y el compartimento intestinal específico.
## Factores que determinan la composición de la microbiota intestinal en termitas
La composición de la microbiota intestinal no es ni aleatoria ni invariable, sino el resultado de múltiples presiones selectivas:
- **Especie hospedadora y filogenia**: la coespeciación entre termitas y sus simbiontes ha producido comunidades altamente específicas; así, _[[Reticulitermes speratus]]_ y _Coptotermes formosanus_ presentan comunidades distintas aunque pertenezcan ambas a _Rhinotermitidae_.
- **Dieta**: la naturaleza del sustrato lignocelulósico (madera seca, madera húmeda, humus, hierba, suelo) condiciona qué taxones predominan; termitas que consumen madera sana y termitas que consumen madera degradada difieren en sus perfiles de protistas y bacterias celulolíticas.
- **Compartimento intestinal**: el intestino anterior, el medio y el posterior (especialmente el paunch) presentan gradientes de pH, potencial redox y concentración de oxígeno que determinan nichos diferenciados; bacterias aerotolerantes prosperan en la periferia del paunch, mientras que anaerobios estrictos dominan el centro.
- **Casta**: [[obreras]], [[soldados]] y reproductores presentan comunidades microbianas con diferente composición y abundancia relativa de sus taxones, en correlación con su función y sus necesidades metabólicas.
- **Etapa del desarrollo y muda**: tras cada [[ecdisis]], las termitas pierden el revestimiento cuticular del intestino posterior y, con él, sus protistas flagelados; la recolonización se produce a través de la [[trofalaxia]] proctodeal con individuos de la colonia.
- **Estado de salud de la colonia**: infecciones por [[hongos entomopatógenos]] o bacterias modifican la composición de la microbiota intestinal, con cambios rápidos en las abundancias relativas de bacterias simbióticas protectoras.
## Composición de la microbiota intestinal en termitas: visión taxonómica resumida
|Grupo|Ejemplos en termitas|Presencia|
|---|---|---|
|**Bacterias**|_Treponema_, _Fibrobacteres_, _Bacteroidota_, _Firmicutes_, _Desulfovibrio_, _Endomicrobium_|Universal; todos los grupos|
|**Arqueas**|_Methanobrevibacter_, _Methanomicrobiales_, _Methanoplasmatales_|Universal; más diversas en termitas superiores|
|**Protistas flagelados**|_Trichonympha_, _Pseudotrichonympha_, _Oxymonas_ (_Parabasalia_, _Oxymonadida_)|Solo termitas inferiores|
|**Hongos**|Levaduras y hongos filamentosos (menos estudiados)|En proporciones bajas; más relevantes en exterior del nido|
|**Virus / fagos**|Bacteriófagos de la microbiota bacteriana|Escasamente caracterizados en termitas|
## Funciones principales de la microbiota intestinal en termitas
La microbiota intestinal cumple funciones sin las cuales la supervivencia de las termitas sería imposible:
- **Digestión de lignocelulosa**: hidrólisis de [[celulosa]] y hemicelulosa mediante CAZimas producidas por protistas y bacterias; fermentación de los productos a ácidos grasos de cadena corta, principalmente [[acetato]].
- **Fijación de [[nitrógeno]] atmosférico**: bacterias endosimbióticas de protistas convierten N₂ en amonio, supliendo la pobreza nitrogenada de la madera.
- **Acetogénesis reductora**: conversión de H₂ + [[CO₂]] en acetato por bacterias del género _Treponema_, que actúa como sumidero de hidrógeno y fuente adicional de carbono asimilable.
- **Metanogénesis**: las arqueas producen CH₄ a partir de H₂; regula el potencial redox del intestino.
- **Síntesis de vitaminas y aminoácidos esenciales**: endosimbiontes bacterianos de protistas codifican biosíntesis de vitaminas del grupo B y aminoácidos no sintetizables por el hospedador.
- **Modulación inmune**: la microbiota residente compite por el nicho con microorganismos patógenos (_exclusión competitiva_); la [[lisozima]] del hospedador la modula activamente, actuando como regulador de la composición bacteriana.
- **Regulación del desarrollo**: señales en forma de cadenas de ácidos grasos emitidas por bacterias intestinales informan al hospedador sobre el estado del lumen, pudiendo influir en la diferenciación de castas a través de vías hormonales.[](https://www.revista.unam.mx/wp-content/uploads/v20_n1_a2_Los-microorganismos-asociados-a-los-insectos-y-su-aplicacion-en-la-agricultura.pdf)
## Microbiota residente frente a microbiota transitoria en el intestino de termitas
En el contexto concreto del intestino de termitas, esta distinción tiene implicaciones prácticas en control de plagas y biología colonial:
- Los **protistas flagelados** son microbiota residente de alta fidelidad: su colonización es obligada para las obreras de termitas inferiores y se transmite de forma vertical; sin ellos, los individuos mueren de inanición aunque ingieran madera.
- Las **bacterias** presentan una fracción residente estable (el llamado _core microbiome_) compartida por todas las obreras de una colonia, y una fracción variable influida por la dieta, el entorno y el estado fisiológico.
- Las **arqueas metanogénicas** son residentes permanentes en proporciones bajas pero constantes.
- Microorganismos del suelo o de la madera (hongos ligninolíticos, bacterias celulolíticas del entorno) pueden comportarse como microbiota transitoria, siendo ingeridos y degradados en el intestino medio sin establecerse de forma estable.
## Dinámica: cómo se ensambla y se mantiene la microbiota intestinal
- **Fundación de una nueva colonia**: la pareja real transporta consigo un subconjunto del microbioma parental, que sirve como inóculo fundador para las primeras obreras de la colonia descendiente.
- **Mantenimiento**: la trofalaxia proctodeal y oral redistribuye microorganismos continuamente entre individuos; los recién mudados reciben inoculación activa de sus compañeras de nido.
- **Reconstitución tras perturbación**: en colonias experimentalmente privadas de microbiota, la recolonización sigue un orden sucesional predecible; los protistas flagelados son los últimos en reestablecerse, requiriendo un huésped previamente colonizado con bacterias.
## Importancia para el control de plagas y biocidas
Comprender la microbiota intestinal de las termitas tiene valor aplicado directo:
- Los biocidas que alteran la microbiota (p. ej., inhibidores de síntesis de pared celular bacteriana, fungicidas de amplio espectro) pueden producir efectos indirectos letales al comprometer la digestión, sin necesidad de actuar directamente sobre el hospedador.
- El conocimiento de la microbiota de _Reticulitermes_ spp., _[[Coptotermes]]_ spp. y _Cryptotermes brevis_ puede orientar el desarrollo de cebos o formulaciones que, ingeridas, desplacen o maten selectivamente los protistas flagelados, provocando inanición de la colonia.
- Las rutas de transmisión proctodeal pueden ser aprovechadas para propagar agentes de control biológico a toda una colonia a partir de un punto de entrada reducido.
## Ayuda para entender (explicación simplificada)
Si el _microbioma_ es la ciudad entera con sus edificios, sus calles, sus normas y sus actividades, la _microbiota_ es simplemente el padrón de sus habitantes: quiénes viven allí, cuántos son y de qué tipo. En el caso de las termitas:
- La **microbiota intestinal** es la lista de todos los seres vivos que habitan el intestino: qué bacterias, qué protistas, qué arqueas hay y en qué cantidad.
- Esa "lista de habitantes" cambia según si el individuo es una obrera que excava y come madera, un [[soldado]] que defiende la colonia o una reina que solo pone huevos.
- Sin esa microbiota residente, la termita no puede digerir la madera, igual que un humano no podría digerir ciertos azúcares sin sus bacterias intestinales.
- La diferencia entre _microbiota_ y _microbioma_ es parecida a la diferencia entre decir "tengo estas personas en casa" (microbiota) y "sé qué hacen, qué habilidades tienen y cómo interactúan entre ellas y conmigo" (microbioma).
## Sinónimos
Flora intestinal (término clásico, en desuso por inexacto, ya que incluye seres no vegetales); comunidad microbiana intestinal; endobiontes intestinales (cuando se enfatiza la relación simbiótica); gut microbiota (ingl.); intestinal microbiota (ingl.).
## Términos relacionados
**Microbioma**:
Conjunto que incluye a la microbiota más la totalidad de sus genomas, metabolitos, elementos genéticos móviles y condiciones fisicoquímicas del hábitat; la microbiota es un subcomponente del microbioma; ver entrada _Microbioma intestinal de termitas_.
**Metagenoma**:
Colección completa del material genético de todos los microorganismos de una comunidad, obtenida sin cultivo previo mediante secuenciación masiva; permite inferir las capacidades metabólicas de la microbiota sin conocer su composición taxonómica.
**Core microbiome** (microbioma nuclear):
Fracción de la microbiota consistentemente presente en todos los individuos de una especie o casta dada, independientemente de variaciones individuales de dieta, edad o entorno; en _Reticulitermes_, incluye determinadas espiroquetas (_Treponema_ spp.) y _Endomicrobium_.
**Disbiosis**:
Alteración de la composición o función de la microbiota intestinal, con pérdida de taxones beneficiosos o proliferación de oportunistas; puede ser inducida experimentalmente por antibióticos, biocidas o cambios de dieta, y resulta en mortalidad o déficits nutricionales en las termitas.
**Trofalaxia proctodeal**:
Transferencia de fluidos del intestino posterior entre individuos de la colonia mediante contacto ano-boca; principal mecanismo de transmisión vertical de la microbiota, especialmente de protistas flagelados, entre obreras adultas e individuos recién mudados.
**Protistas flagelados intestinales**:
Microorganismos eucariotas anaerobios del intestino posterior de termitas inferiores (_Parabasalia_, _Oxymonadida_) que constituyen el componente más voluminoso y metabólicamente central de la microbiota de estas termitas; ausentes en termitas superiores.
**Lisozima**:
Enzima antibacteriana del hospedador presente en saliva, huevos y tracto digestivo; modula activamente la composición de la microbiota bacteriana intestinal y actúa como feromona de reconocimiento de huevos; ver entrada _Lisozima en termitas_.
## Bloque
[Parte III. Biología molecular y ecológica de termitas → Cap. 4. Digestión simbiótica y microbioma → Subapartado 4.1. Terminología fundamental → Entrada "Microbiota intestinal (definición, distinción de microbioma y aplicación en termitas)"]
## Fuentes (source)
Sebastián-Domingo J.J. y Sánchez-Sánchez C. (2018). "De la flora intestinal al microbioma." _Revista Española de Enfermedades Digestivas_ 110(1): 51–56.
Referencia clínica y terminológica que establece la distinción precisa entre microbiota, microbioma y metagenoma en el contexto científico actual.
Grupo de trabajo del Consejo Científico Asesor del Microbioma (Whipps, Lewis, Cooke 1988; Berg et al. 2020). Definiciones canónicas del término microbioma y su relación con microbiota, adoptadas por la comunidad científica internacional.[](https://es.wikipedia.org/wiki/Microbioma)
Revista UNAM — Microorganismos asociados a insectos (2019). Artículo de divulgación científica que sistematiza las funciones de la microbiota intestinal en insectos, incluyendo termitas, con perspectiva nutricional y de desarrollo.[](https://www.revista.unam.mx/wp-content/uploads/v20_n1_a2_Los-microorganismos-asociados-a-los-insectos-y-su-aplicacion-en-la-agricultura.pdf)
Revistas _Environmental Microbiology_, _ISME Journal_ y _Applied and Environmental Microbiology_: corpus principal de estudios metagenómicos y transcriptómicos sobre composición y función de la microbiota intestinal en _Reticulitermes_, _Nasutitermes_, _Coptotermes_ y _Macrotermes_.